Crijevna mikrobiota može imati ključnu ulogu u liječenju dijabetesa tipa 2
U bolesnika s dijabetesom tipa 2, sastav crijevne mikrobiote često se pomiče prema povećanom broju fakultativno anaerobnih bakterija, smanjenoj raznolikosti i manjem broju korisnih obveznih anaeroba, što je stanje poznato kao disbioza. Ova disbioza nije ujednačena kod svih pacijenata, već značajno varira zbog čimbenika kao što su prehrana, lijekovi i imunološko zdravlje, koji mogu na različite načine pridonijeti napredovanju bolesti.